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Academic Year: 2021/22

32529 - DEEPENING THE THEORETICAL CHEMISTRY METHODS

This is a non-sworn machine translation intended to provide students with general information about the course. As the translation from Spanish to English has not been post-edited, it may be inaccurate and potentially contain errors. We do not accept any liability for errors of this kind. The course guides for the subjects taught in English have been translated by their teaching teams


Teaching Plan Information

Code - Course title:
32529 - DEEPENING THE THEORETICAL CHEMISTRY METHODS
Degree:
616 - Máster en Química Teórica y Modelización Computacional (2013)
651 - Máster Erasmus Mundus en Química Teórica y Modelización Computacional
748 -
751 - Máster en Química Teórica y Modelización Computacional Europeo
762 -
Faculty:
104 - Facultad de Ciencias
Academic year:
2021/22

1. Course details

1.1. Content area

Deepening in Methods of Theoretical Chemistry

1.2. Course nature

Optional

1.3. Course level

Máster (EQF/MECU 7)

1.4. Year of study

1

1.5. Semester

Annual

1.6. ECTS Credit allotment

5.0

1.7. Language of instruction

English

1.8. Prerequisites

There are no previous prerequisites

1.9. Recommendations

There are no recommendations.

1.10. Minimum attendance requirement

Attendance is mandatory

1.11. Subject coordinator

1.12. Competences and learning outcomes

1.12.1. Competences

These learning objectives contribute to provide the following skills for the students:


BASIC AND GENERAL SKILLS

CB6 – To possess and understand knowledge that provides a basis or opportunity to be original in the development and/or application of ideas, often in a research context.

CB7 – That students know how to apply the acquired knowledge and their ability to solve problems in new or unfamiliar environments within broader (or multidisciplinary) contexts related to their area of study.

CB8 – That students are able to integrate knowledge and face the complexity of making judgments from information that, incomplete or limited, includes reflections on the social and ethical responsibilities linked to the application of their knowledge and judgments.

CB9 – That students know how to communicate their conclusions and the knowledge and ultimate reasons that sustain them to specialized and non-specialized audiences in a clear and unambiguous way.

CB10 – That students have the learning skills that allow them to continue studying in a way that will be largely self-directed or autonomous.

CG01 – That students are able to promote, in academic and professional contexts, technological and scientific advancement within a society based on knowledge and respect for: a) fundamental rights and equal opportunities between men and women, b) the principles of equal opportunities and universal accessibility for people with disabilities, and c) the values of a culture of peace and democratic values.

CG02 – That students are able to solve problems and make decisions of any kind under the commitment to the defense and practice of equality policies.

TRANVERSAL SKILLS

CT02 – That students are organized at work demonstrating that they know how to manage the time and resources available.

SPECIFIC SKILLS
CE01- Students demonstrate their knowledge and understanding of the facts by applying concepts, principles and theories related to the Theoretical Chemistry and Computational Modeling.

CE04 - To understand the theoretical and practical foundations of Computational techniques with which they can analyze the electronic, morphological and structural structure of a compound and properly interpret the results.

CE15 – To understand the basic principles of "ab initio" methodologies and Density Functional Theory.

CE16 - Students are able to discern between the different existing methods and know how to select the most appropriate method for each problem.

1.12.2. Learning outcomes

The purpose of this course is to provide students a deeper insight into the methods used in theoretical chemistry, with particular emphasis on students to deepen in the following aspects:

- Knowledge of the specific problems of quantum mechanical methods applied to large systems.
- Understanding and ability to discriminate between different analytical methods useful for solving one-electron and two-electron molecular integrals depending on the nature of these integrals.
- Understanding of the essential features of the numerical methods used to solve molecular integrals. As a result, ability to change parameters for each method in order to solve practical problems and to choose the most appropriate method for a
specific problem.
- Detailed knowledge of some methods that accelerate the process of solving selfconsistent equations.
- Knowledge of the fundamentals of local methods to evaluate the correlation energy.
- Detailed knowledge of the methodological grounds of most common methods
- Ability to estimate computational cost and scaling
- Estimation of the magnitude of the errors associated
- Ability to determine their applicability to a specific problem.
-Density functional theory: advanced math, functionals and recent concepts.
-Challenges for density functional theory.

1.12.3. Course objectives

-

1.13. Course contents

- One-electron molecular integrals. Properties and analytical and numerical techniques.
- Two-electron molecular integrals. Screening, direct methods, decomposition techniques. Pseudospectral methods. Use of multipolar expansion.
- SCF Equations. Convergence. Methods adapted to sparse matrices.
- Efficiency of the method and scaling. Computational Cost.
- Introduction to electron correlation.
- Wavefunction-based methods:
        Configuration Interaction
        Coupled Cluster
        Perturbation theory. MPn methods
        Multireference methods
- Basis sets for electron correlation
- Introduction to explicitly correlated methods.
- Local methods for electron correlation.
- Intermolecular systems. Interaction energy partitioning methods.
-Density Functional Theory (DFT)
- Exchange-correlation functional development: from LDA, GGA, hybrids to recent ideas
- Exact conditions, adiabatic connection and other approaches
-Kohn-Sham eigenvalues and the OEP method
-Extension of DFT to fractional particle numbers and fractional spins: delocalization error and static correlation error
-Time dependent DFT: linear response and explicit time propagation
-Challenges for currently used approximations in DFT: strong correlation
-The exact energy functional of DFT

 

1.14. Course bibliography

-F. Jensen, Introduction to Computational Chemistry, John Wiley & Sons, Chichester, 1999.
-D. B. Cook, Handbook of Computational Quantum Chemistry, Oxford University Press, Oxford, 1998.
-A. Szabo and N. S. Ostlund, Modern Quantum Chemistry, Dover publications Mineola, 1996.
-T. Helgaker and P. R. Taylor, Gaussian basis sets and molecular integrals, World Sientific, Singapore, 1995.
-D. R. Yarkony (Ed.) Direct Methods in Electronic Structure Theory, Vol. part I, World Scientific, Sinapore, 1995.
-Helgaker, T., Jørgensen, P., Olsen, J.; Molecular Electronic-Structure Theory. John Wiley & Sons Ltd, 2000.
-Roos, B. Editor; Lecture notes in quantum chemistry: European summer school in quantum chemistry. Springer-Verlag 1994. Chapters on CC, CI, MCSCF, calibration.
-Robert G. Parr and Weitao Yang: Density Functional Theory for Atoms and Molecules. Oxford University Press, 1994.
-A. J. Cohen, P. Mori-Sánchez and W. Yang, Challenges for Density Functional Theory, Chemical Reviews, 112, 208 (2012).
-Dreizler and Gross, Density Functional Theory: An approach to the quantum manybody problem, Springer-Verlag (1990).
-Axel Becke, Perspective: Fifty years of density-functional theory in chemical physics J. Chem. Phys. 140, 18A301 (2014).

2. Teaching-and-learning methodologies and student workload

2.1. Contact hours

 

#horas

Contact hours (minimum 33%)

35

Independent study time

90

2.2. List of training activities

Activity

# hours

Lectures

20

Seminars

15

Practical sessions

 

Clinical sessions

 

Computer lab

 

 

 

Laboratory

 

Work placement

 

Supervised study

 

Tutorials

 

Assessment activities

 

Other

 

Lecture: The Professor will deliver face-to-face, or, online video lectures about the theoretical contents of the course during two-hour sessions. The presentations will be based on the different materials available at the Moodle platform.

Network teaching: All the tools available at the Moodle website (https://posgrado.uam.es) will be used (uploading of teaching materials, utilization of work team strategies, wiki, blogs, e-mail, etc.).

Tutoring sessions: The professor can organize either individual or group tutoring sessions about particular topics and questions raised by students.

Online Seminars: After the lecturing period, online seminars between the Professor and the students will be arranged at the virtual classroom in order to discuss the results being obtained, the potential problems and difficulties in using the various methodologies as well as to supervise the preparation of the required reports.

 

3. Evaluation procedures and weight of components in the final grade

3.1. Regular assessment

El aprendizaje y la formación adquirida por el estudiante serán evaluados a lo largo de todo el curso, intentando que el estudiante avance de forma regular y constante en la asimilación de los contenidos de la asignatura.
La nota final de la asignatura se basará en los ejercicios, trabajos y discusión de los mismos que se irá realizando durante el curso. Dichos trabajos se puntuarán en base a los siguientes porcentajes:

-90 % la memoria presentada por el estudiante.
-10 % la discusión que sobre la misma se realice con el profesor en tutorías y seminarios.

3.1.1. List of evaluation activities

Evaluatory activity

%

Final exam

 

Continuous assessment

 

3.2. Resit

Contents that were failed in the ordinary assessment will be re-assessed through written reports focused on those contents. They will be done personally by the student in a fixed time period.

3.2.1. List of evaluation activities

Evaluatory activity

%

Final exam

 

Continuous assessment

 

4. Proposed workplan

Please check the official schedule published on the Master's website.


Curso Académico: 2021/22

32529 - PROFUNDIZACIÓN EN LOS MÉTODOS DE LA QUÍMICA TEÓRICA


Información del Plan Docente

Código - Nombre:
32529 - PROFUNDIZACIÓN EN LOS MÉTODOS DE LA QUÍMICA TEÓRICA
Titulación:
616 - Máster en Química Teórica y Modelización Computacional (2013)
651 - Máster Erasmus Mundus en Química Teórica y Modelización Computacional
748 - Máster Erasmus Mundus en Química Teórica y Modelización Computacional
751 - Máster en Química Teórica y Modelización Computacional Europeo
762 - Máster en Química Teórica y Modelización Computacional (2021)
Centro:
104 - Facultad de Ciencias
Curso Académico:
2021/22

1. Detalles de la asignatura

1.1. Materia

Profundización en los Métodos de la Química Teórica.

1.2. Carácter

Optativa

1.3. Nivel

Máster (MECES 3)

1.4. Curso

1

1.5. Semestre

Anual

1.6. Número de créditos ECTS

5.0

1.7. Idioma

English

1.8. Requisitos previos

No hay.

1.9. Recomendaciones

No hay.

1.10. Requisitos mínimos de asistencia

La asistencia a las clases es obligatoria.

1.11. Coordinador/a de la asignatura

1.12. Competencias y resultados del aprendizaje

1.12.1. Competencias

BÁSICAS Y GENERALES:

CB6 - Poseer y comprender conocimientos que aporten una base u oportunidad de ser originales en el desarrollo y/o aplicación de ideas, a menudo en un contexto de investigación.
CB7 - Que los estudiantes sepan aplicar los conocimientos adquiridos y su capacidad de resolución de problemas en entornos nuevos o poco conocidos dentro de contextos más amplios (o multidisciplinares) relacionados con su área de estudio.
CB8 - Que los estudiantes sean capaces de integrar conocimientos y enfrentarse a la complejidad de formular juicios a partir de una información que, siendo incompleta o limitada, incluya reflexiones sobre las responsabilidades sociales y éticas vinculadas a la aplicación de sus conocimientos y juicios.
CB9 - Que los estudiantes sepan comunicar sus conclusiones y los conocimientos y razones últimas que las sustentan a públicos especializados y no especializados de un modo claro y sin ambigüedades.
CB10 - Que los estudiantes posean las habilidades de aprendizaje que les permitan continuar estudiando de un modo que habrá de ser en gran medida autodirigido o autónomo.
CG01 - Los estudiantes son capaces de fomentar, en contextos académicos y profesionales, el avance tecnológico y científico dentro de una sociedad basada en el conocimiento y en el respeto a: a) los derechos fundamentales y de igualdad de oportunidades entre hombres y mujeres, b) los principios de igualdad de oportunidades y accesibilidad universal de las personas con discapacidad y c) los valores propios de una cultura de paz y de valores democráticos.
CG02 - Los estudiantes son capaces de resolver problemas y tomar decisiones de cualquier índole bajo el compromiso con la defensa y práctica de las políticas de igualdad.

TRANSVERSALES:

CT02 - El/la estudiante es organizado en el trabajo demostrando que sabe gestionar el tiempo y los recursos de que dispone.

ESPECÍFICAS:

CE01 - Los estudiantes demuestran su conocimiento y comprensión de los hechos aplicando conceptos, principios y teorías relacionadas con la Química Teórica y Modelización Computacional.
CE04 - Comprende los fundamentos teóricos y prácticos de técnicas computacionales con las que puede analizar la estructura electrónica, morfológica y estructural de un compuesto e interpreta adecuadamente los resultados.
CE15 - Entiende los principios básicos de las metodologías "ab initio" y Teoría de los Funcionales de la Densidad.
CE16 - El/la estudiante es capaz de discernir entre los diferentes métodos existentes y cómo seleccionar el más adecuado para cada problema.

1.12.2. Resultados de aprendizaje

El objeto del presente curso es proporcionar a los estudiantes una visión más profunda de los métodos empleados en Química teórica, haciendo especial hincapié en que los estudiantes profundicen en los siguientes aspectos:

- Conocimiento de la problemática específica de los métodos mecanocuánticos aplicados a sistemas de gran tamaño.

- comprensión y capacidad de discriminación entre distintos métodos analíticos útiles para resolver integrales moleculares monoelectrónicas y bielectrónicas según la naturaleza de dichas integrales.

- Comprensión de las características esenciales de los métodos numéricos utilizados para resolver integrales moleculares. Como consecuencia, capacidad para modificar parámetros propios de cada método para resolver problemas prácticos y para escoger el método más adecuado a un problema concreto.

- Conocimiento detallado de algunos métodos que aceleran el proceso de resolución de ecuaciones autoconsistentes.

- Conocimiento de los fundamentos de los métodos locales para evaluar la energía de correlación.

- Conocimiento detallado de las bases metodológicas de los métodos más comunes.

- Capacidad para estimar coste computacional y escalado

- Estimación de la magnitud de los errores asociados

- Capacidad para determinar su posibilidad de aplicación a un problema concreto.

- Teoría del funcional de la densidad: matemática avanzada, funcionales y conceptos recientes.

- Retos y perspectivas de la teoría del funcional de la densidad.

1.12.3. Objetivos de la asignatura

-

1.13. Contenidos del programa

- Integrales moleculares monoelectrónicas. Propiedades y técnicas de cálculo analíticas y numéricas.
- Integrales moleculares bielectrónicas. Screening, métodos directos, técnicas de descomposición. Métodos pseudoespectrales. Aplicación del desarrollo multipolar.
- Ecuaciones SCF. Convergencia. Métodos adaptados a matrices dispersas.
- Eficiencia y escalado de los métodos. Coste computacional.
- Introducción a la correlación electrónica.
- Métodos basados en la función de onda:
Interacción de configuraciones
Coupled Cluster
Teoría de Perturbaciones. Métodos MPn
Métodos multireferenciales
- Bases para el cálculo de la energía de correlación.
- Introducción a los métodos explícitamente correlacionados.
- Métodos locales de correlación electrónica.
- Sistemas Intermoleculares. Métodos de partición de la energía de interacción.
- Teoría del Funcional de la Densidad (DFT)
- Desarrollo de funcionales de intercambio-correlación: LDA, GGA, híbridos e ideas recientes -Condiciones exactas, conexión adiabática y otras aproximaciones
-Autoenergías Kohn-Sham y el método OEP
-Extensión a sistemas con un número no entero de partículas y espín: error de deslocalización electrónica y error de correlación estática
-DFT dependiente del tiempo: respuesta lineal y propagación explícita en el tiempo
-Grandes retos de las aproximaciones más populares en DFT: sistemas fuertemente correlacionados
-El funcional exacto de DFT

1.14. Referencias de consulta

F. Jensen, Introduction to Computational Chemistry, John Wiley & Sons, Chichester, 1999

D. B. Cook, Handbook of Computational Quantum Chemistry, Oxford University Press, Oxford, 1998

A. Szabo and N. S. Ostlund, Modern Quantum Chemistry, Dover publications Mineola, 1996

T. Helgaker and P. R. Taylor, Gaussian basis sets and molecular integrals, World Sientific, Singapore, 1995

D. R. Yarkony (Ed.) Direct Methods in Electronic Structure Theory, Vol. part I, World Scientific, Sinapore, 1995

Helgaker, T., Jørgensen, P., Olsen, J.; Molecular Electronic-Structure Theory. John Wiley & Sons Ltd, 2000.

Roos, B. Editor; Lecture notes in quantum chemistry: European summer school in quantum chemistry. Springer-Verlag 1994. Chapters on CC, CI, MCSCF, calibration.

Robert G. Parr and Weitao Yang: Density Functional Theory for Atoms and Molecules. Oxford University Press, 1994.

A. J. Cohen, P. Mori-Sánchez and W. Yang, Challenges for Density Functional Theory, Chemical Reviews, 112, 208 (2012).

Dreizler and Gross, Density Functional Theory: An approach to the quantum many-body problem, Springer-Verlag (1990)

Axel Becke, Perspective: Fifty years of density-functional theory in chemical physics J. Chem. Phys. 140, 18A301 (2014)

2. Metodologías docentes y tiempo de trabajo del estudiante

2.1. Presencialidad

 

#horas

Porcentaje de actividades presenciales (mínimo 33% del total)

35

Porcentaje de actividades no presenciales

90

2.2. Relación de actividades formativas

Actividades presenciales

Nº horas

Clases teóricas en aula

20

Seminarios

15

Clases prácticas en aula

 

Prácticas clínicas

 

Prácticas con medios informáticos

 

Prácticas de campo

 

Prácticas de laboratorio

 

Prácticas externas y/o practicum

 

Trabajos académicamente dirigidos

 

Tutorías

 

Actividades de evaluación

 

Otras

 

Lección Magistral: El profesor expondrá los contenidos del curso en sesiones presenciales, o, por video conferencia de dos horas basándose en los materiales docentes publicados en la plataforma Moodle.

Docencia en red. Se utilizará las distintas herramientas que ofrece la plataforma Moodle (https://posgrado.uam.es). Publicación de contenidos de la asignatura, herramientas de trabajo en grupo: foros de discusión y wiki, correo electrónico

Tutorías. El profesor realizará tutorías individuales o con grupos reducidos sobre cuestiones puntuales que los estudiantes puedan plantear.

Seminarios online. Con posterioridad a las clases expositivas, se realizarán seminarios online para discutir los resultados obtenidos en los trabajos propuestos, las dudas sobre las metodologías empleadas, y supervisar la preparación de los informes elaborados por los estudiantes.

3. Sistemas de evaluación y porcentaje en la calificación final

3.1. Convocatoria ordinaria

El aprendizaje y la formación adquirida por el estudiante serán evaluados a lo largo de todo el curso, intentando que el estudiante avance de forma regular y constante en la asimilación de los contenidos de la asignatura.
La nota final de la asignatura se basará en los ejercicios, trabajos y discusión de los mismos que se irá realizando durante el curso. Dichos trabajos se puntuarán en base a los siguientes porcentajes:

- 90 % la memoria presentada por el estudiante,
- 10 % la discusión que sobre la misma se realice con el profesor en tutorías y seminarios.

3.1.1. Relación actividades de evaluación

Actividad de evaluación

%

Examen final (máximo 70% de la calificación final o el porcentaje que figure en la memoria)

 

Evaluación continua

 

3.2. Convocatoria extraordinaria

Se evaluarán los contenidos suspensos en la convocatoria ordinaria por medio de trabajos centrados en dichos contenidos, que el alumno realizará de forma personal en un plazo fijado.

3.2.1. Relación actividades de evaluación

Actividad de evaluación

%

Examen final (máximo 70% de la calificación final o el porcentaje que figure en la memoria)

 

Evaluación continua

 

4. Cronograma orientativo

Por favor, comprobar el horario oficial publicado en la página web del Máster.