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Academic Year of Degree: 2025/26

18208 - INTRODUCTION TO MICROBIOLOGY

This is a non-sworn machine translation intended to provide students with general information about the course. As the translation from Spanish to English has not been post-edited, it may be inaccurate and potentially contain errors. We do not accept any liability for errors of this kind. The course guides for the subjects taught in English have been translated by their teaching teams


Teaching Plan Information

Code - Course title:
18208 - INTRODUCTION TO MICROBIOLOGY
Degree:
531 - Graduado/a en Bioquímica
829 - Microtítulo en Biología Molecular para Ciencias Experimentales
Faculty:
104 - Facultad de Ciencias
Academic year:
2025/26

1. Course details

1.1. Content area

Microbiology.

1.2. Course nature

531 - Basic Training
829 - Optional

1.3. Course level

531 - Grado (EQF/MECU 6)
829 - Estudios Propios (EQF/MECU 6)

1.4. Year of study

1

1.5. Semester

Second semester

1.6. ECTS Credit allotment

6.0

1.7. Language of instruction

Español

1.8. Prerequisites

None.

1.9. Recommendations

It is highly recommended to have studied the subject of Chemistry and Biology Foundations and be enrolled in the subject of Biochemistry Foundations.

Have an English level that allows the student to read bibliography of consultation.

1.10. Minimum attendance requirement

The assistance to the class of theory is highly recommended.

Assistance to practical classes, discussion of cases or presentations of work by students is mandatory.

1.11. Subject coordinator

Miguel Angel Rodriguez Gabriel

1.12. Competences and learning outcomes

1.12.1. Competences / Results of the training and learning outcomes

Specific competencies of the Degree in Biochemistry by the UAM

CE3.- Know and understand the differences between procarote and eukaryotic cells, as well as the structure and function of the different cell types (in multicellular organisms) and their subcellular orgánulos.

CE5.- Understand the structure of the cell membranes and their role in the transport of molecules, energy transduction and signal transduction.

CE6.- Understand the structure, organization, expression, regulation and evolution of genes in living organisms, as well as the molecular bases of genetic and epigenetic variation among individuals.

CE10.- Having an integrated vision of cell function (including metabolism and gene expression), covering its regulation and the relationship between different cellular compartments.

General Competences of the Degree in Biochemistry by the UAM

CG1.- To possess and understand the fundamental knowledge about the organization and function of biological systems at cell and molecular levels, being able to discern the different molecular mechanisms and the chemical transformations responsible for a biological process. These knowledge will be supported in advanced textbooks, but will also include some aspects of sources of scientific literature from the avant-garde of knowledge in the field of Biochemistry and Molecular Biology.

CG2.- Know how to apply knowledge in Biochemistry and Molecular Biology to the professional world, especially in the areas of research and teaching, and of biosanitary activities, including the ability to resolve issues and problems in the field of Molecule Biosciences using the scientific method.

CG3.- Ability to collect and interpret relevant data within the area of Biochemistry and Molecular Biology, as well as to draw conclusions and critically reflect on them in different relevant topics in the field of Molecule Biosciences.

CG5.- To have developed the learning skills necessary to undertake subsequent studies of specialization with a high degree of autonomy, including the ability to assimilate the different scientific and technological innovations that are taking place in the field of Molecule Biosciences.

Cross-cutting competencies of the Degree in Biochemistry by the UAM

CT1.- Critical and self-critical reasoning capacity.

CT5.- Ability to apply the principles of the scientific method.

1.12.2. Learning outcomes

  • Name and know the main groups of microorganisms.
  • Use microbiological techniques and methods for the study of microorganisms.
  • Apply the basic knowledge of microbiology to solve complex problems.
  • Design and discuss experiments to demonstrate microbiological facts through the scientific method.
  • Determine the biochemical characteristics that distinguish different groups of microorganisms (Bacteria, Archaea and Eukarya).
  • Biochemically argue the metabolic and molecular biology differences and similarities between bacteria, arches and eukaryotes.
  • Evaluate the interest of different applications of Microbiology.

1.12.3. Course objectives

Within the objectives of the course, the student must reach competencies that enable him to acquire and understand the fundamental knowledge about the organization and function of microbiological systems at the cell and molecular levels as well as to discern the different molecular mechanisms and the chemical transformations responsible for these biological processes.

It will also advance the understanding of the influence of microorganisms on human life, from diseases to energy production or the influence of microorganisms on agriculture and livestock.

Teacher and student will be supported in advanced textbooks and in the sources of the cutting-edge scientific literature, so that the student can apply the knowledge acquired to the professional world, especially in the areas of research, teaching and biosanitary. To do this, you must use the scientific method that will also be used in teaching the subject, promoting the student's critical and self-critical thinking.

The course will promote the search, collection and interpretation of relevant data within the area of Biochemistry and Molecular Biology, from the point of view of Microbiology.

In short, the main objective of this subject is to promote knowledge of Microbiology, from Biochemistry and Molecular Biology. Through the teaching methodology employed and the training activities developed throughout the course, at the end of the course the student will be able to achieve the learning results.

1.13. Course contents

Summary of contents:

The microorganisms and their diversity. Basic microbiological methods. Biology of the procaritic cell. Classification and phlogeny of microorganisms. Relations of microorganisms with man and animals. Microorganisms and environment. Industrial microbiology.

Contents:

Unit 1. Basics of microbiology

  • Microorganisms and microbiology
  • Microbial evolution and systematic
  • Diversity in Bacteria and Archaea
  • Structure and functions of microbial cells

Unit 2. Metabolism and energy.

  • Microbial metabolism
  • Breathing
  • Fermentation
  • Light-dependent metabolisms
  • Chemotrophy

Unit 3. Growth and control

  • Growth of microorganisms
  • Growth control

Unit 4. Molecular biology, regulation and genomics

  • Molecular biology
  • Regulation
  • Genetics in Bacteria and Archaea
  • Genomics and Metagenomy

Unit 5. Virus

  • Virus and virology
  • Viral genomes and diversity

Unit 6. Microorganisms and health

  • Microbial interactions with humans
  • Infections
  • Epidemiology
  • Bacterial and viral diseases of contagion person to person
  • Bacterial and viral diseases other transmissions

Unit 7. Environmental and industrial microbiology

  • Methods of study in microbial ecology
  • Microbial ecosystems
  • Cycles of nutrients
  • Microbial symbiosis
  • Industrial microbiology
  • Genetic engineering and biotechnology

Practice classes (4 hours x 4 days):

Practice I: Identification of a bacteria problem.

Preparation and sterilization of crop media.

Siembra of microorganisms.

Microscopic observation of microorganisms.

Biochemical identification tests.

Standardized biochemical tests.

Qualitative and quantitative antibiograms.

Practice II: Insulation of bacteria from complex mixture.

Use of selective means of cultivation

Sequential monitoring of microbiological tests

Insulation of pure crops of microorganisms

Practice III: Insulation of dairy bacteria

Insulation of commercial dairy bacteria

1.14. Course bibliography

-

2. Teaching-and-learning methodologies and student workload

2.1. Contact hours

 

#horas

Contact hours (minimum 33%)

 

Independent study time

 

2.2. List of training activities

Activity

# hours

Lectures

 

Seminars

 

Practical sessions

 

Clinical sessions

 

Computer lab

 

 

 

Laboratory

 

Work placement

 

Supervised study

 

Tutorials

 

Assessment activities

 

Other

 

3. Evaluation procedures and weight of components in the final grade

3.1. Regular assessment

The learning results related to the competencies listed above will be evaluated throughout the course through different evaluation methods, the contribution to the final qualification will be as follows:

  1. Oral and/or written examinations (partial and final): 60% of the final rating.

To compute in the final grade of the subject this 60%, the average note obtained by partial or the one obtained in the final examination should be equal to or above 5/10.

Partial review of the first half of the semester (30 %)

Partial review of the second half of the semester (30 %)

or

Final review with a value of 60% of the final rating

Note: In partials the student will have to obtain a minimum of 3/10. In case of obtaining a note less than 3/10 in either of the two partial examinations, the student must perform the final examination with all the matter.

Students approved in partial examinations also have the possibility of making the final examination. In this case, the largest of the notes obtained will be computed (by partial examinations or final examination).

  1. Resolution of problems and practical cases: 15% of the final score.
  2. Assistance, practice notebooks and review of practices: 15% of the final rating (Minimum rating = 5/10).
  3. Assistance and participation in seminars and/or presentation of individual oral work in group: 10% of the final score.

In practical classes, group work and exercises will evaluate the competences related to the application of theoretical content to problem solving, the chemical transformations responsible for biological processes, collect and interpret relevant data from the area of Biochemistry and Molecular Biology, autonomous learning, as well as the capacity of critical and autocritical thinking and the application of the principles of the scientific method

3.1.1. List of evaluation activities

Evaluatory activity

%

Final exam

 

Continuous assessment

 

3.2. Resit

In the extraordinary call the procedures, evaluation criteria and percentage in the final rating will be the same as the ordinary call.

Practices will be required.

3.2.1. List of evaluation activities

Evaluatory activity

%

Final exam

 

Continuous assessment

 

4. Proposed workplan

Presence

Week

Contents

Theory

Practices

Review

1

Block I (9 hours)

3

2

¿

3

3

¿

3

4

Block II (22 hours)

2

5

¿

3

6

¿

4

7

¿

4

8

¿

4

9

¿

4

10

¿

2

11

Block III (7 hours)

2

15*

12

¿

2

15*

13

¿

3

14

Final activities

3

15

16

Final review

3

Totals

42

15

3

60

*This timetable is indicative.


Curso Académico: 2025/26

18208 - INTRODUCCIÓN A LA MICROBIOLOGÍA


Información del Plan Docente

Código - Nombre:
18208 - INTRODUCCIÓN A LA MICROBIOLOGÍA
Titulación:
531 - Graduado/a en Bioquímica
829 - Microtítulo en Biología Molecular para Ciencias Experimentales
Centro:
104 - Facultad de Ciencias
Curso Académico:
2025/26

1. Detalles de la asignatura

1.1. Materia

Microbiología.

1.2. Carácter

531 - Formación básica
829 - Optativa

1.3. Nivel

531 - Grado (MECES 2)
829 - Estudios Propios (MECES 2)

1.4. Curso

1

1.5. Semestre

Segundo semestre

1.6. Número de créditos ECTS

6.0

1.7. Idioma

Español. Se emplea también inglés en material docente.

1.8. Requisitos previos

Ninguno.

1.9. Recomendaciones

Es muy recomendable haber cursado la asignatura de Química y Fundamentos de Biología y estar matriculado en la asignatura de Fundamentos de Bioquímica.

Disponer de un nivel de inglés que permita al alumno leer bibliografía de consulta.

1.10. Requisitos mínimos de asistencia

La asistencia a clase de teoría es muy recomendable.

La asistencia a clases prácticas, de discusión de casos o de presentaciones de trabajos por los alumnos es obligatoria.

1.11. Coordinador/a de la asignatura

Miguel Angel Rodriguez Gabriel

1.12. Competencias y resultados del aprendizaje

1.12.1. Competencias / Resultados del proceso de formación y aprendizaje

Competencias específicas del Grado en Bioquímica por la UAM

CE3.- Conocer y entender las diferencias entre células procariotas y eucariotas, así como la estructura y función de los distintos tipos celulares (en organismos multicelulares) y de sus orgánulos subcelulares.

CE5.- Comprender la estructura de las membranas celulares y su papel en el transporte de moléculas, transducción de energía y transducción de señales.

CE6.- Comprender la estructura, organización, expresión, regulación y evolución de los genes en los organismos vivos, así como las bases moleculares de la variación genética y epigenética entre individuos.

CE10.- Tener una visión integrada del funcionamiento celular (incluyendo el metabolismo y la expresión génica), abarcando su regulación y la relación entre los diferentes compartimentos celulares.

 

Competencias Generales del Grado en Bioquímica por la UAM

CG1.- Poseer y comprender los conocimientos fundamentales acerca de la organización y función de los sistemas biológicos en los niveles celular y molecular, siendo capaces de discernir los diferentes mecanismos moleculares y las transformaciones químicas responsables de un proceso biológico. Estos conocimientos se apoyarán en los libros de texto avanzadas, pero también incluirán algunos aspectos de fuentes de la literatura científica de la vanguardia del conocimiento en el ámbito de la Bioquímica y Biología Molecular.

CG2.- Saber aplicar los conocimientos en Bioquímica y Biología Molecular al mundo profesional, especialmente en las áreas de investigación y docencia, y de actividades biosanitarias, incluyendo la capacidad de resolución de cuestiones y problemas en el ámbito de las Biociencias Moleculares utilizando el método científico.

CG3.- Capacidad de reunir e interpretar datos relevantes dentro del área de la Bioquímica y Biología Molecular, así como de extraer conclusiones y reflexionar críticamente sobre las mismas en distintos temas relevantes en el ámbito de las Biociencias Moleculares.

CG5.- Haber desarrollado las habilidades de aprendizaje necesarias para emprender estudios posteriores de especialización con un alto grado de autonomía, incluyendo la capacidad de asimilación de las distintas innovaciones científicas y tecnológicas que se vayan produciendo en el ámbito de las Biociencias Moleculares.

 

Competencias transversales del Grado en Bioquímica por la UAM

CT1.- Capacidad de razonamiento crítico y autocrítico.

CT5.- Capacidad para aplicar los principios del método científico.

1.12.2. Resultados de aprendizaje

  • Nombrar y conocer los grupos principales de microorganismos.
  • Emplear técnicas y métodos microbiológicos para el estudio de microorganismos.
  • Aplicar los conocimientos básicos de la microbiología para resolver problemas complejos.
  • Diseñar y discutir experimentos que permitan demostrar, a través del método científico, hechos microbiológicos.
  • Determinar las características bioquímicas que distinguen a los distintos grupos de microorganismos (Bacteria, Archaea y Eukarya).
  • Argumentar bioquímicamente las diferencias y similitudes metabólicas y de biología molecular entre bacterias, arqueas y eucariotas.
  • Evaluar el interés de distintas aplicaciones de la Microbiología.

1.12.3. Objetivos de la asignatura

Dentro de los objetivos del curso, el alumno deberá alcanzar competencias que le permitan adquirir y comprender los conocimientos fundamentales acerca de la organización y función de los sistemas microbiológicos en los niveles celular y molecular así como discernir los diferentes mecanismos moleculares y las transformaciones químicas responsables de estos procesos biológicos.

También se avanzará en la comprensión de la influencia de los microorganismos en la vida humana, desde las enfermedades a la producción de energía o la influencia de los microorganismos en la agricultura y la ganadería.

Profesor y alumno se apoyarán en libros de texto avanzados y en las fuentes de la literatura científica de vanguardia, con el fin de que el alumno pueda aplicar los conocimientos adquiridos al mundo profesional, especialmente en las áreas de investigación, docencia y biosanitaria. Para ello deberá utilizar el método científico que también será utilizado en la docencia de la asignatura, promoviendo el pensamiento crítico y autocrítico del alumno.

El curso promoverá la búsqueda, recopilación e interpretación de datos relevantes dentro del área de la Bioquímica y la Biología Molecular, desde el punto de vista de la Microbiología.

En resumen, el objetivo principal de esta asignatura es fomentar el conocimiento de la Microbiología, desde la Bioquímica y la Biología Molecular. A través de la metodología docente empleada y las actividades formativas desarrolladas a lo largo del curso, al finalizar el mismo el estudiante será capaz de alcanzar los resultados de aprendizaje.

1.13. Contenidos del programa

Resumen contenidos:

Los microorganismos y su diversidad. Métodos microbiológicos básicos. Biología de la célula procariótica. Clasificación y filogenia de los microorganismos. Relaciones de los microorganismos con el hombre y los animales. Microorganismos y medio ambiente. Microbiología industrial.

Contenidos:

Unidad 1. Fundamentos de la microbiología

  • Microorganismos y microbiología
  • Evolución y sistemática microbianas
  • Diversidad en Bacteria y Archaea
  • Estructura y funciones de las células microbianas

 

Unidad 2. Metabolismo y energía.

  • Metabolismo microbiano
  • Respiraciones
  • Fermentaciones
  • Metabolismos dependientes de la luz
  • Quimiotrofía

Unidad 3. Crecimiento y control

  • Crecimiento de microorganismos
  • Control del crecimiento

Unidad 4. Biología molecular, regulación y genómica

  • Biología molecular
  • Regulación
  • Genética en Bacteria y Archaea
  • Genómica y metagenómica

Unidad 5. Virus

  • Virus y virología
  • Genomas víricos y diversidad

Unidad 6. Microorganismos y salud

  • Interacciones microbianas con los humanos
  • Infecciones
  • Epidemiología
  • Enfermedades bacterianas y víricas de contagio persona a persona
  • Enfermedades bacterianas y víricas otras transmisiones

Unidad 7. Microbiología ambiental e industrial

  • Métodos de estudio en ecología microbiana
  • Ecosistemas microbianos
  • Ciclos de los nutrientes
  • Simbiosis microbianas
  • Microbiología industrial
  • Ingeniería genética y biotecnología

 

Clases Prácticas (4 horas x 4 días):

Práctica I: Identificación de una bacteria problema.

Preparación y esterilización de medios de cultivo.

Siembra de microorganismos.

Observación microscópica de microorganismos.

Pruebas bioquímicas de identificación.

Ensayos bioquímicos estandarizados.

Antibiogramas cualitativos y cuantitativos.

Práctica II: Aislamiento de bacterias a partir de mezcla compleja.

      Utilización de medios selectivos de cultivo

      Seguimiento secuencial de pruebas microbiológicas

      Aislamiento de cultivos puros de microorganismos

Práctica III: Aislamiento de bacterias lácticas

       Aislamiento de bacterias de productos lácteos comerciales

1.14. Referencias de consulta

Imprescindibles:

“Brock: Biología de los microorganismos”. Madigan, Martinko, Bender, Buckley y Stahl. 14ª edición. Pearson.

 

Recomendadas:

“Prescott /Harley/Klein’s Microbiology”. Willey, Sherwood y Woolverton. 8th edition. McGraw-Hill Science.

“Microbe hunters”. Paul de Kruif. Mariner books.

Artículos seleccionados de Investigación y Ciencia u otras revistas divulgativas

 

Recursos digitales:

https://moodle.uam.es/

2. Metodologías docentes y tiempo de trabajo del estudiante

2.1. Presencialidad

 

#horas

Porcentaje de actividades presenciales (mínimo 33% del total)

61

Porcentaje de actividades no presenciales

89

2.2. Relación de actividades formativas

Actividades presenciales

Nº horas

Clases teóricas en aula

36

Seminarios

6

Clases prácticas en aula

 

Prácticas clínicas

 

Prácticas con medios informáticos

 

Prácticas de campo

 

Prácticas de laboratorio

16

Prácticas externas y/o practicum

 

Trabajos académicamente dirigidos

 

Tutorías

 

Actividades de evaluación

3

Otras

 

 

 

Actividades formativas

Metodología de enseñanza-aprendizaje

Clases expositivas, resolución de problemas y de casos prácticos

Clases “magistrales” con soporte de TIC, complementadas con discusiones con los estudiantes, donde se explican los conceptos básicos de las materias y se aplican dichos conocimientos a la solución de problemas y de casos prácticos.

Prácticas de laboratorio

Utilización del instrumental de laboratorio y aplicación de los conocimientos adquiridos.

Seminarios de casos prácticos y exposición de trabajos dirigidos

Clases reducidas en las que los estudiantes presentan y discuten problemas prácticos y otros temas relevantes.

Tutorías individuales y/o en grupos reducidos

Sesiones concertadas para resolver dudas y mantener discusiones sobre aspectos específicos de las materias.

Evaluación

Pruebas escritas (parciales y finales).

Estudio y trabajo autónomo del estudiante

  • Búsqueda de documentación.
  • Reflexión y profundización en los conocimientos mediante la bibliografía recomendada.
  • Resolución de problemas y casos prácticos.
  • Preparación de trabajos dirigidos.
  • Prácticas autónomas de ordenador.
  • Realización de esquemas, mapas conceptuales y resúmenes.
  • Estudio y asimilación de los conceptos básicos de las materias.

 

Apoyo de:

Artículos de revisión para comentar

Casos en Microbiología

Podcasts

Notas de prensa

Problemas prácticos (aprendizaje basado en problemas)

3. Sistemas de evaluación y porcentaje en la calificación final

3.1. Convocatoria ordinaria

Los resultados del aprendizaje relacionados con las competencias enumeradas anteriormente serán evaluados a lo largo del curso mediante diferentes métodos de evaluación, cuya contribución a la calificación final será la siguiente:

  1. Exámenes orales y/o escritos (parciales y finales): 60% de la calificación final.

Para computar en la calificación final de la asignatura este 60%, la nota media obtenida por parciales o la obtenida en el examen final deberá ser igual o superior a 5/10.

Examen parcial de la primera mitad del semestre (30 %)

Examen parcial de la segunda mitad del semestre (30 %)

o

Examen final con un valor del 60 % de la calificación final

Nota: En los parciales el alumno tendrá que obtener un mínimo de 3/10. En caso de obtener nota inferior a 3/10 en cualquiera de los dos exámenes parciales, el alumno deberá realizar el examen final con toda la materia.

Los alumnos aprobados en exámenes parciales también tienen posibilidad de hacer el examen final. En tal caso, se computará la mayor de las notas obtenidas (media de exámenes parciales o examen final).

  1. Resolución de problemas y casos prácticos: 15% de la calificación final.
  2. Asistencia, realización de cuadernos de prácticas y examen de prácticas: 15% de la calificación final (Calificación mínima = 5/10).
  3. Asistencia y participación en seminarios y/o exposición de trabajos orales individuales en grupo: 10% de la calificación final.

En las clases prácticas, trabajos de grupo y ejercicios de evaluarán las competencias relacionadas con la aplicación de los contenidos teóricos a la resolución de problemas, las transformaciones químicas responsables de los procesos biológicos, reunir e interpretar datos relevantes del área de la Bioquímica y la Biología Molecular, el aprendizaje autónomo, así como la capacidad de pensamiento crítico y autocrítico y la aplicación de los principios del método científico

3.1.1. Relación actividades de evaluación

Actividad de evaluación

%

Examen final (máximo 70% de la calificación final o el porcentaje que figure en la memoria)

60

Prácticas

15

Ejercicios

15

Seminarios y trabajos

10

 

 

 

3.2. Convocatoria extraordinaria

En la convocatoria extraordinaria los procedimientos, criterios de evaluación y porcentaje en la calificación final serán los mismos que la convocatoria ordinaria.

Será necesario haber cursado las prácticas.

3.2.1. Relación actividades de evaluación

Actividad de evaluación

%

Examen final (máximo 70% de la calificación final o el porcentaje que figure en la memoria)

60

Prácticas

 

15

Ejercicios

15

Seminarios y trabajos

10

 

4. Cronograma orientativo

 

 

Presencial

 

Semana

Contenido

Teoría

Practicas

Examen

1

Bloque I (9 horas)

3

 

 

2

3

 

 

3

3

 

 

4

Bloque II (22 horas)

2

 

 

5

3

 

 

6

4

 

 

7

4

 

 

8

4

 

 

9

4

 

 

10

2

 

 

11

Bloque III (7 horas)

2

15*

 

12

2

15*

 

13

3

 

 

14

Actividades finales

3

 

 

15

 

 

 

 

16

Examen Final

 

 

3

Totales

 

42

15

3

 

 

 

 

60

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

*Este cronograma tiene carácter orientativo.